15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1174 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1174  putative bacteriophage protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.552425  normal  0.0203947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0815  putative bacteriophage protein  84.4 
 
 
250 aa  440  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.760606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2408  putative bacteriophage protein  54.03 
 
 
251 aa  271  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1806  putative bacteriophage protein  55.22 
 
 
229 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2247  hypothetical protein  53.74 
 
 
223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.425538 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1287  hypothetical protein  35.63 
 
 
213 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1256  hypothetical protein  36.14 
 
 
213 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1019  hypothetical protein  35.22 
 
 
213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3649  hypothetical protein  38.22 
 
 
220 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2202  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.773621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2935  hypothetical protein  30.16 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1240  hypothetical protein  31.15 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  25.24 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4461  tail spike  29.7 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  29.71 
 
 
205 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>