29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3735 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3735  Phage-related baseplate assembly protein V  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1046  phage baseplate assembly protein V  37.06 
 
 
197 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4589  Phage baseplate assembly protein V  38.59 
 
 
170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1160  Phage baseplate assembly protein V  37.16 
 
 
169 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3862  phage assembly protein, putative  35.33 
 
 
166 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1814  putative phage baseplate assembly protein  40.28 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2586  phage baseplate assembly protein V  38.14 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0640174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0187  phage baseplate assembly protein V  34.2 
 
 
216 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0694  bacteriophage Mu Gp45 protein  31.52 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0743  bacteriophage Mu Gp45 protein  31.52 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0746  phage baseplate assembly protein V  31.09 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2700  prophage MuSo2, baseplate assembly protein V  30.99 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4479  bacteriophage Mu Gp45 protein  30.98 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2250  bacteriophage Mu Gp45 protein  30.98 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2253  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.46 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000590369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3115  Mu Gp45 domain-containing protein  24.49 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  27.27 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2735  phage baseplate assembly protein  24.03 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2813  phage baseplate assembly protein V  24.03 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1471  phage baseplate assembly protein  24.03 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.388674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3049  putative baseplate assembly protein Gp45,Mu-like  28.12 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  40.32 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  28.86 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4484  Mu-like prophage protein gp45-like protein  29.31 
 
 
185 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2086  bacteriophage Mu Gp45 protein  28.81 
 
 
193 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22100  hypothetical protein  38.55 
 
 
241 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406161  unclonable  3.23411e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  43.14 
 
 
180 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  33.33 
 
 
250 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1286  hypothetical protein  37.1 
 
 
223 aa  41.2  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>