20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4484 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4484  Mu-like prophage protein gp45-like protein  100 
 
 		 185 aa  361  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2446  Mu-like prophage protein GP45-like protein  36.89 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0187  phage baseplate assembly protein V  25.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2253  bacteriophage Mu Gp45 protein  35.79 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4479  bacteriophage Mu Gp45 protein  35.79 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2250  bacteriophage Mu Gp45 protein  35.79 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1160  Phage baseplate assembly protein V  27.66 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4589  Phage baseplate assembly protein V  26.06 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2586  phage baseplate assembly protein V  30.39 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0640174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3862  phage assembly protein, putative  27.34 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  34.51 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2700  prophage MuSo2, baseplate assembly protein V  29.81 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1046  phage baseplate assembly protein V  25.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2086  bacteriophage Mu Gp45 protein  27.78 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0746  phage baseplate assembly protein V  27.27 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3735  Phage-related baseplate assembly protein V  29.31 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6585  putative bacteriophage protein, gp45-like protein  30.36 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  39.66 
 
 		 174 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2813  phage baseplate assembly protein V  26.62 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2735  phage baseplate assembly protein  26.62 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>