16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41816 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  100 
 
 
398 aa  832    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  100 
 
 
398 aa  832    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  41.08 
 
 
521 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 
429 aa  280  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  40.33 
 
 
458 aa  272  9e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  40.05 
 
 
437 aa  270  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  25.57 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  24.26 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  30.41 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  23.81 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  23.9 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  25.21 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  27.65 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  22.36 
 
 
390 aa  46.6  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  28.21 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  28.1 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>