More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0056 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0056  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  100 
 
 
225 aa  444  1e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.185509  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0064  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  85.71 
 
 
225 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0098  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  71.5 
 
 
219 aa  303  1e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0196  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  66.36 
 
 
218 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0071  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  66.2 
 
 
213 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00571088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0636  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  64.98 
 
 
218 aa  268  6e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0636214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0393  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  68.22 
 
 
218 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0809  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  54.07 
 
 
227 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0667  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  52.58 
 
 
218 aa  218  4e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2926  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.7 
 
 
222 aa  213  2e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.212855  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0144  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.95 
 
 
215 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2027  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  52.15 
 
 
227 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0202  Phosphoribosylanthranilate isomerase  56.52 
 
 
215 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1692  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  56.95 
 
 
270 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280488  hitchhiker  4.87855e-07 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0177  phosphoribosylanthranilate isomerase  56.35 
 
 
215 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3236  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  50 
 
 
215 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3885  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  55.07 
 
 
212 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.523686  normal  0.722804 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3272  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  54.59 
 
 
212 aa  199  4e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.353986 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3587  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  54.59 
 
 
212 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3953  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  48.1 
 
 
222 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.132267  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3587  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  53.69 
 
 
215 aa  196  2e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26697  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4280  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  45.41 
 
 
222 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3789  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.77 
 
 
215 aa  194  8e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167739  hitchhiker  0.0064312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0119  Phosphoribosylanthranilate isomerase  56.35 
 
 
215 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3425  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  48.11 
 
 
218 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2111  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  52.15 
 
 
222 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1029  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.11 
 
 
228 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96854  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0146  Phosphoribosylanthranilate isomerase  56.13 
 
 
242 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0019  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  48.58 
 
 
224 aa  184  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2442  phosphoribosylanthranilate isomerase  57.44 
 
 
219 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1304  phosphoribosylanthranilate isomerase  49.76 
 
 
229 aa  174  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2506  phosphoribosylanthranilate isomerase  52.26 
 
 
225 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0660467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2203  N-(5'phosphoribosyl)anthranilate isomerase (PRAI)  50.72 
 
 
222 aa  167  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0204  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  47.37 
 
 
215 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1065  phosphoribosylanthranilate isomerase  42.86 
 
 
213 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.660088  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2035  Phosphoribosylanthranilate isomerase  42.72 
 
 
224 aa  146  2e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.11252  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0094  phosphoribosylanthranilate isomerase  45.85 
 
 
211 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2725  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  41.06 
 
 
217 aa  140  2e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.902512  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1722  phosphoribosylanthranilate isomerase  42.58 
 
 
205 aa  134  2e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.214814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4975  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  43.48 
 
 
213 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1160  Phosphoribosylanthranilate isomerase  40.76 
 
 
251 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1984  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.01 
 
 
230 aa  129  4e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2138  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.05 
 
 
233 aa  127  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1814  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.05 
 
 
233 aa  127  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0442544  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0771  phosphoribosylanthranilate isomerase  41.86 
 
 
224 aa  125  8e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1050  Phosphoribosylanthranilate isomerase  39.44 
 
 
228 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.392103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2468  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.91 
 
 
231 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2307  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.95 
 
 
238 aa  120  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0802  phosphoribosylanthranilate isomerase  37.14 
 
 
212 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0635156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1915  phosphoribosylanthranilate isomerase  42.72 
 
 
205 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370127  normal  0.693187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2331  phosphoribosylanthranilate isomerase  37.85 
 
 
210 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3794  Phosphoribosylanthranilate isomerase  28.77 
 
 
216 aa  117  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1158  Phosphoribosylanthranilate isomerase  39.44 
 
 
209 aa  117  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1559  phosphoribosylanthranilate isomerase  36.32 
 
 
209 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1212  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.57 
 
 
205 aa  115  4e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1736  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.16 
 
 
203 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2158  phosphoribosylanthranilate isomerase  38.39 
 
 
213 aa  115  7e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0832153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1416  Phosphoribosylanthranilate isomerase  37.17 
 
 
231 aa  114  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1913  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  34.88 
 
 
208 aa  114  1e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5476  Phosphoribosylanthranilate isomerase  33.33 
 
 
214 aa  114  1e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.766607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2882  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  39.5 
 
 
237 aa  113  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0071709  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3063  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.57 
 
 
207 aa  113  2e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0770  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2308  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1209  phosphoribosylanthranilate isomerase  31.03 
 
 
207 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2446  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4373  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.74 
 
 
235 aa  112  4e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4032  Phosphoribosylanthranilate isomerase  33.62 
 
 
242 aa  112  4e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1681  phosphoribosylanthranilate isomerase  40.37 
 
 
220 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2126  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.14 
 
 
233 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639678  decreased coverage  0.00415793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01268  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.44 
 
 
222 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0528  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  112  7e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.649184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1857  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  112  7e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1722  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  112  7e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1648  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
253 aa  112  7e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0466  phosphoribosylanthranilate isomerase  33.48 
 
 
227 aa  112  7e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4199  Phosphoribosylanthranilate isomerase  40.95 
 
 
207 aa  111  7e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000908275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1865  phosphoribosylanthranilate isomerase  33.33 
 
 
203 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0809  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  32.21 
 
 
205 aa  110  1e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0786  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  32.21 
 
 
205 aa  110  1e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0754  phosphoribosylanthranilate isomerase  32.56 
 
 
219 aa  111  1e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349409  normal  0.658174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3347  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.21 
 
 
233 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.205386  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1187  phosphoribosylanthranilate isomerase  39.15 
 
 
204 aa  110  2e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00213067  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3852  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.21 
 
 
233 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2041  phosphoribosylanthranilate isomerase  34.43 
 
 
205 aa  110  2e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1250  Phosphoribosylanthranilate isomerase  34.26 
 
 
208 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2378  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.16 
 
 
203 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0678  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.74 
 
 
246 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6843  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.5 
 
 
237 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182026  normal  0.302461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4172  phosphoribosylanthranilate isomerase  40.85 
 
 
207 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2492  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.5 
 
 
202 aa  108  9e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1897  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  35.92 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2266  phosphoribosylanthranilate isomerase  37.74 
 
 
214 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0340766  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1048  Phosphoribosylanthranilate isomerase  35.29 
 
 
218 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34210  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  39.42 
 
 
206 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1292  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.16 
 
 
209 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1336  Phosphoribosylanthranilate isomerase  37.96 
 
 
209 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2850  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.36 
 
 
218 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1267  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  32.04 
 
 
207 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1266  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  32.52 
 
 
207 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>