More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1467 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.74 
 
 
326 aa  328  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.14 
 
 
275 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.3 
 
 
264 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.04 
 
 
272 aa  291  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.16 
 
 
263 aa  288  9e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  56.64 
 
 
266 aa  288  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.13 
 
 
267 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.23 
 
 
267 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.44 
 
 
242 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.85 
 
 
328 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.84 
 
 
329 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  45.16 
 
 
249 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.67 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.83 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  42.31 
 
 
260 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.22 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  42.19 
 
 
258 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.82 
 
 
307 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.74 
 
 
367 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  44.84 
 
 
332 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.42 
 
 
307 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.96 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.22 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.28 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  41.63 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  46.64 
 
 
319 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  45.1 
 
 
253 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.85 
 
 
303 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  45.24 
 
 
294 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.25 
 
 
302 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 
362 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.9 
 
 
253 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  41.41 
 
 
254 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
317 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  42.52 
 
 
253 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.7 
 
 
255 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  44.71 
 
 
255 aa  208  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  45.24 
 
 
315 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.52 
 
 
253 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.09 
 
 
299 aa  208  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  42.52 
 
 
253 aa  208  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.82 
 
 
302 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.09 
 
 
254 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  43.31 
 
 
253 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.74 
 
 
259 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 
322 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.16 
 
 
255 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  44.62 
 
 
348 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.41 
 
 
255 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.7 
 
 
303 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  40.16 
 
 
257 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  40.16 
 
 
257 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.73 
 
 
253 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  44.05 
 
 
290 aa  204  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.35 
 
 
274 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.91 
 
 
339 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  43.31 
 
 
253 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.35 
 
 
253 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 
287 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.02 
 
 
254 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.25 
 
 
257 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  43.53 
 
 
257 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.13 
 
 
254 aa  201  9e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.31 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  40.39 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.31 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  41.86 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.55 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.02 
 
 
261 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  43.94 
 
 
262 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.45 
 
 
267 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.31 
 
 
268 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.69 
 
 
298 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  42.86 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.19 
 
 
253 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.03 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.24 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.35 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.11 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.86 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.42 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.7 
 
 
300 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  43.58 
 
 
262 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  40.91 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
257 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  40.32 
 
 
257 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  43.7 
 
 
314 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 
256 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.39 
 
 
257 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 
257 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>