16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0456 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  100 
 
 
2764 aa  5422    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  26.74 
 
 
689 aa  91.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  27.03 
 
 
668 aa  89  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  27.03 
 
 
668 aa  89  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  27.74 
 
 
628 aa  73.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.56 
 
 
9585 aa  63.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  34.11 
 
 
1937 aa  63.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  34.38 
 
 
1467 aa  59.3  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  24.31 
 
 
769 aa  58.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.94 
 
 
1821 aa  57.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3035  hypothetical protein  23.37 
 
 
676 aa  52.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  22.82 
 
 
562 aa  51.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  25.54 
 
 
497 aa  48.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  21.94 
 
 
771 aa  48.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.85 
 
 
3471 aa  46.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  33.85 
 
 
3472 aa  46.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>