22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0092 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0092  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
246 aa  504  1e-142  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1215  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.63 
 
 
275 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  23.44 
 
 
448 aa  51.6  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  22.83 
 
 
427 aa  51.6  1e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  22.44 
 
 
427 aa  50.1  3e-05  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.71 
 
 
432 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.76582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.15 
 
 
434 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08960  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  26.42 
 
 
418 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  21.65 
 
 
427 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  22.43 
 
 
435 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  23.68 
 
 
505 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2029  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  23.53 
 
 
472 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  21.65 
 
 
427 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13093  putative UDP-ManNAc dehydrogenase  25.75 
 
 
405 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27920  nucleotide sugar dehydrogenase  20.83 
 
 
417 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  20.93 
 
 
424 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.35 
 
 
433 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  21.29 
 
 
438 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  23.85 
 
 
445 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.21 
 
 
442 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2340  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.85 
 
 
439 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  21.56 
 
 
423 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>