58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1215 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1215  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0092  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.63 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.89 
 
 		 434 aa  62.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.77 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  27.31 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  28.9 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2340  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.68 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  28.33 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.81 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  30.65 
 
 		 428 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  26.56 
 
 		 461 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.83 
 
 		 435 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4732  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.12 
 
 		 436 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4644  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.12 
 
 		 436 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5027  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.12 
 
 		 436 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.73 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  28.88 
 
 		 434 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3042  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  22.59 
 
 		 419 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3069  nucleotide sugar dehydrogenase  32.8 
 
 		 426 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  27.44 
 
 		 440 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.14 
 
 		 442 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7121  nucleotide sugar dehydrogenase  26.54 
 
 		 450 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168128  normal  0.1616 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  27.07 
 
 		 447 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.89 
 
 		 438 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.24 
 
 		 435 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.17 
 
 		 448 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  27 
 
 		 420 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.87 
 
 		 423 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  26.38 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.8 
 
 		 435 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.05 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  30.52 
 
 		 432 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  30.99 
 
 		 451 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2029  nucleotide sugar dehydrogenase  31.55 
 
 		 455 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.13 
 
 		 419 aa  46.2  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  28.95 
 
 		 437 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.11 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.9 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.44 
 
 		 442 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.34 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  30.36 
 
 		 415 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  26.7 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.32 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6677  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.62 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  29.44 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 413 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  33.12 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  26.4 
 
 		 416 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3259  nucleotide sugar dehydrogenase  26.12 
 
 		 426 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2609  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.27 
 
 		 420 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0202798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  26.37 
 
 		 442 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8169  nucleotide sugar dehydrogenase  28.67 
 
 		 403 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5506  nucleotide sugar dehydrogenase  25.17 
 
 		 428 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00306815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  28.5 
 
 		 439 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  28.8 
 
 		 439 aa  42.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.06 
 
 		 445 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.1 
 
 		 418 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>