14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2682 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  42.65 
 
 
374 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  34.93 
 
 
309 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  30.22 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  32.3 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  32.51 
 
 
205 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  29.33 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  27.45 
 
 
464 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  28.5 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  26.78 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  28.92 
 
 
235 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  24.63 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  28.91 
 
 
751 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  32.79 
 
 
281 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>