46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0073 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  75.91 
 
 
491 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  85.45 
 
 
493 aa  863    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  75.91 
 
 
491 aa  761    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  988    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  75.91 
 
 
491 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  63.69 
 
 
480 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  35.81 
 
 
538 aa  263  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  37.22 
 
 
510 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  37.02 
 
 
512 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  36.51 
 
 
486 aa  242  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  34.09 
 
 
504 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  34.09 
 
 
504 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  35.9 
 
 
516 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  35.44 
 
 
516 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  35.44 
 
 
516 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  33.54 
 
 
505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  31.44 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  34.89 
 
 
496 aa  213  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  32.66 
 
 
495 aa  203  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  32.84 
 
 
461 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  30.27 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  31.34 
 
 
482 aa  163  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  27.11 
 
 
540 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  30.44 
 
 
453 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  27.9 
 
 
519 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  35.16 
 
 
457 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  35.16 
 
 
457 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  35.16 
 
 
485 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  27.31 
 
 
448 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  27.44 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  25.42 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  27.07 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  26.73 
 
 
481 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  27.01 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  27.44 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  24.58 
 
 
483 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  27.01 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  31.33 
 
 
459 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  24.38 
 
 
487 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  25.63 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  27.01 
 
 
470 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  24.31 
 
 
458 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  24.9 
 
 
454 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  25.35 
 
 
488 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  35.71 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  31.67 
 
 
459 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>