19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1635 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  64.55 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  37.01 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  36.29 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  40.1 
 
 		 203 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  37 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  36.32 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  34.25 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  34.47 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  31.86 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  31.55 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  29.55 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  30.77 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  27.82 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12896  GrpE protein, HSP90 cofactor, chloroplast targeted  25.62 
 
 		 525 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  33.85 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  33.85 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86611  Predicted component of NuA3 histone acetyltransferase complex  26.54 
 
 		 610 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>