21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7806 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 261 aa  526  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1677  xylose isomerase domain-containing protein  62.84 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2319  xylose isomerase domain-containing protein  60.92 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7181  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.98 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123498  normal  0.0907339 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.96 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0110067  normal  0.529558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4269  xylose isomerase domain-containing protein  53.64 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3496  iolI protein  53.21 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3270  AP endonuclease  51.7 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50090  myo-inositol catabolism protein  53.38 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2685  xylose isomerase domain-containing protein  51.31 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2074  xylose isomerase-like TIM barrel  51.31 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6013  xylose isomerase-like TIM barrel  49.81 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2738  xylose isomerase domain-containing protein  47.57 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2714  xylose isomerase domain-containing protein  50.75 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1245  putative protein implicated IN myo-inositol catabolique pathway  47.58 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2926  xylose isomerase domain-containing protein  47.58 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  0.384731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0612  xylose isomerase domain-containing protein  47.94 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3284  xylose isomerase domain-containing protein  49.8 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00754219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4717  xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.16 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4665  xylose isomerase domain-containing protein  34.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  29.86 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>