30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4954 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4954  glycerol dehydratase  100 
 
 
739 aa  1484  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1245  glycerol dehydratase  87.79 
 
 
746 aa  1279  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00307379  decreased coverage  4.39875e-06 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5335  glycerol dehydratase  99.86 
 
 
739 aa  1481  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5563  glycerol dehydratase  87.25 
 
 
746 aa  1273  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5042  glycerol dehydratase  100 
 
 
739 aa  1484  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359522  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1953  glycerol dehydratase  49.82 
 
 
554 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1031  Glycerol dehydratase  50 
 
 
553 aa  545  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00671582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2281  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.31 
 
 
554 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2263  propanediol utilization dehydratase large subunit  50.93 
 
 
554 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.131408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2217  propanediol utilization dehydratase large subunit  51.12 
 
 
554 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2163  propanediol utilization dehydratase, large subunit  50.93 
 
 
554 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2376  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.12 
 
 
554 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2210  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.12 
 
 
554 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0284  Glycerol dehydratase  50.28 
 
 
564 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1173  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, large subunit  48.42 
 
 
554 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1004  glycerol dehydratase, alpha subunit  48.42 
 
 
554 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.872763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1747  glycerol dehydratase  48.04 
 
 
558 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1952  dehydratase, medium subunit  40 
 
 
229 aa  147  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0285  dehydratase medium subunit  45.51 
 
 
197 aa  143  1e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1005  glycerol dehydratase, beta subunit  45.25 
 
 
188 aa  142  2e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.295335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1174  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, medium subunit  44.69 
 
 
188 aa  142  2e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1032  dehydratase medium subunit  45.88 
 
 
224 aa  140  8e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00834098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2264  propanediol dehydratase medium subunit  39.57 
 
 
224 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.140255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2164  propanediol dehydratase medium subunit  40.57 
 
 
224 aa  134  8e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2211  propanediol dehydratase medium subunit  40.57 
 
 
224 aa  134  8e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2377  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  40.57 
 
 
224 aa  133  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2218  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  40.57 
 
 
224 aa  133  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2282  propanediol utilization dehydratase, medium subunit  39.77 
 
 
222 aa  133  1e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1746  dehydratase, medium subunit  42.94 
 
 
236 aa  120  1e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1949  hypothetical protein  36.08 
 
 
121 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>