30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5563 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4954  glycerol dehydratase  87.25 
 
 		 739 aa  1278    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1245  glycerol dehydratase  94.49 
 
 		 746 aa  1380    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00307379  decreased coverage  0.00000439875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5042  glycerol dehydratase  87.25 
 
 		 739 aa  1278    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5563  glycerol dehydratase  100 
 
 		 746 aa  1504    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5335  glycerol dehydratase  87.25 
 
 		 739 aa  1278    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1953  glycerol dehydratase  51.37 
 
 		 554 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1031  Glycerol dehydratase  49.72 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00671582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1173  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, large subunit  50.19 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1004  glycerol dehydratase, alpha subunit  50.19 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.872763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2281  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.37 
 
 		 554 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2376  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.55 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2217  propanediol utilization dehydratase large subunit  51.55 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2163  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.37 
 
 		 554 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2263  propanediol utilization dehydratase large subunit  51.37 
 
 		 554 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.131408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2210  propanediol utilization dehydratase, large subunit  51.55 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0284  Glycerol dehydratase  50 
 
 		 564 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1747  glycerol dehydratase  47.87 
 
 		 558 aa  505  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1952  dehydratase, medium subunit  40.51 
 
 		 229 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1005  glycerol dehydratase, beta subunit  45.21 
 
 		 188 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.295335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1174  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, medium subunit  44.68 
 
 		 188 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2282  propanediol utilization dehydratase, medium subunit  41.34 
 
 		 222 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1032  dehydratase medium subunit  43.23 
 
 		 224 aa  141  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00834098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2264  propanediol dehydratase medium subunit  42.22 
 
 		 224 aa  141  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.140255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2211  propanediol dehydratase medium subunit  42.22 
 
 		 224 aa  141  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2164  propanediol dehydratase medium subunit  42.22 
 
 		 224 aa  141  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0285  dehydratase medium subunit  45.2 
 
 		 197 aa  140  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2377  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  42.22 
 
 		 224 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2218  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  42.22 
 
 		 224 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1746  dehydratase, medium subunit  42.94 
 
 		 236 aa  124  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1949  hypothetical protein  36.08 
 
 		 121 aa  45.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>