18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2377 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2377  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2218  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2164  propanediol dehydratase medium subunit  99.11 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2211  propanediol dehydratase medium subunit  99.11 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2264  propanediol dehydratase medium subunit  98.66 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.140255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2282  propanediol utilization dehydratase, medium subunit  86.61 
 
 		 222 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1746  dehydratase, medium subunit  55.79 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1032  dehydratase medium subunit  53.51 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00834098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1952  dehydratase, medium subunit  53.18 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1005  glycerol dehydratase, beta subunit  64 
 
 		 188 aa  224  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.295335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1174  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, medium subunit  64 
 
 		 188 aa  224  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0285  dehydratase medium subunit  55.91 
 
 		 197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1245  glycerol dehydratase  42.05 
 
 		 746 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00307379  decreased coverage  0.00000439875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5563  glycerol dehydratase  42.22 
 
 		 746 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5335  glycerol dehydratase  41.52 
 
 		 739 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5042  glycerol dehydratase  40.94 
 
 		 739 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4954  glycerol dehydratase  40.94 
 
 		 739 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1949  hypothetical protein  34.69 
 
 		 121 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>