46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0065 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  984  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  75.2 
 
 
493 aa  739  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  99.8 
 
 
491 aa  983  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  984  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  75.91 
 
 
495 aa  745  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  65.75 
 
 
480 aa  612  1e-174  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  39.18 
 
 
510 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  36.31 
 
 
538 aa  259  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  35.14 
 
 
504 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  35.14 
 
 
504 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  36.59 
 
 
512 aa  254  2e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  35.46 
 
 
486 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  34.29 
 
 
506 aa  240  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  35.66 
 
 
516 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  35.66 
 
 
516 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  35.66 
 
 
516 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  34.3 
 
 
495 aa  220  4e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  34.9 
 
 
496 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  32.93 
 
 
505 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  31.58 
 
 
461 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  31.22 
 
 
472 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  31.6 
 
 
482 aa  167  3e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  34.1 
 
 
457 aa  163  5e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  34.1 
 
 
457 aa  163  5e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  34.1 
 
 
485 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  31.77 
 
 
453 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  28.11 
 
 
540 aa  142  1e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  27.27 
 
 
519 aa  117  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  30.69 
 
 
481 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  26.95 
 
 
467 aa  85.5  2e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  25.16 
 
 
448 aa  84.3  4e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  26.46 
 
 
467 aa  81.3  4e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  26.56 
 
 
472 aa  77.4  6e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  26.14 
 
 
479 aa  72.4  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  26.06 
 
 
510 aa  70.5  7e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  25.59 
 
 
454 aa  69.7  1e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.09999e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  27.37 
 
 
458 aa  69.7  1e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  25.05 
 
 
483 aa  67.8  4e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  23.3 
 
 
487 aa  64.7  3e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  25.69 
 
 
453 aa  63.9  7e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  30.3 
 
 
459 aa  62.8  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  28.76 
 
 
464 aa  61.6  3e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  33.81 
 
 
482 aa  58.9  2e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  25.25 
 
 
470 aa  52  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  23.31 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  26.24 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>