More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0718 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  100 
 
 		 87 aa  184  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  121  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  119  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1762  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  116  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  70.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 74 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  72.22 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  68.92 
 
 		 83 aa  114  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0744  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1713  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.846652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1981  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2366  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.302955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2266  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2691  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000360853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>