45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1195 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  99.03 
 
 
310 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  96.45 
 
 
310 aa  610  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  82.9 
 
 
310 aa  545  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  56.8 
 
 
288 aa  350  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  38.79 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  39.05 
 
 
294 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  39.05 
 
 
294 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  45.89 
 
 
197 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  45.52 
 
 
649 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  31.71 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  30.5 
 
 
269 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  40.12 
 
 
291 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 
559 aa  135  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  38.32 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  43.83 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  31.58 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  45.71 
 
 
456 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  44.93 
 
 
270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  34.43 
 
 
270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  38.51 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  30.84 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  31.25 
 
 
268 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  38.85 
 
 
540 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  43.07 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  36.11 
 
 
446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  43.12 
 
 
195 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  32.67 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  41.25 
 
 
258 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5466  protein of unknown function DUF147  29.11 
 
 
270 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  33.77 
 
 
269 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  38.81 
 
 
259 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  30.43 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  40.58 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  31.76 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3595  pyruvate kinase  31.58 
 
 
477 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  28.03 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  33.77 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  39.44 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000602517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  37.66 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2673  protein of unknown function DUF147  37.35 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0979308 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  34.72 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  35.44 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  29.09 
 
 
277 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  38.24 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>