26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0695 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  100 
 
 
170 aa  345  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  57.99 
 
 
167 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  41.92 
 
 
179 aa  137  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  41.21 
 
 
178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  43.87 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  43.62 
 
 
159 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  43.14 
 
 
162 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  42.48 
 
 
162 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  41.83 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  41.83 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  40.4 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  40.65 
 
 
151 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  44 
 
 
152 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  39.22 
 
 
155 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  35.95 
 
 
302 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  37.5 
 
 
301 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  37.91 
 
 
302 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  37.5 
 
 
301 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  30.06 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  28.21 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  28.85 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  30.07 
 
 
272 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  28.21 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  29.11 
 
 
286 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  33.33 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  34.92 
 
 
165 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>