65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1429 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  741    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1856  acyltransferase 3  31.12 
 
 
372 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  37.91 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  27.44 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2451  acyltransferase 3  24.75 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0727  hypothetical protein  24.81 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  28.18 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  28.18 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  27.73 
 
 
343 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  27.73 
 
 
343 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  27.73 
 
 
343 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  31.79 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  30.87 
 
 
352 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  24.47 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1450  acyltransferase 3  24.78 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.012691  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  28.3 
 
 
337 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  31.94 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  31.94 
 
 
331 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  25.53 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  31.4 
 
 
355 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2246  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal  0.322709 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1364  acyltransferase  25.81 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.510476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  31.94 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  31.94 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  31.94 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  31.94 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  31.94 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  31.25 
 
 
331 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  31.25 
 
 
331 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2177  hypothetical protein  30.22 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  31.03 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  31.03 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  31.03 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  31.03 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0863  acyltransferase  30.67 
 
 
166 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.340911  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0172  hypothetical protein  34.83 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000866641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  25.87 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  23.56 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  31.03 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1444  acyltransferase 3  24.08 
 
 
460 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  29.17 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  32.98 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1319  hypothetical protein  23.32 
 
 
438 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1377  hypothetical protein  22.54 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1141  acyltransferase 3  23.86 
 
 
361 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283735  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  31.72 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  28.21 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  33.67 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  31.72 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  31.72 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  28.96 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  28.28 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  36.19 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  36.73 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4522  acyltransferase 3  29.93 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  35.19 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  25.97 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.74 
 
 
695 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  30.56 
 
 
330 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  34.31 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  28.57 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  35.63 
 
 
361 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  28.97 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>