18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1398 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2332  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00672726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2637  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.813016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0023  hypothetical protein  37.14 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0996823  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4416  hypothetical protein  39.53 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1035  hypothetical protein  39.62 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0540  hypothetical protein  36.25 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00507326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2099  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2828  hypothetical protein  27.4 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1375  hypothetical protein  32.5 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.48826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0016  hypothetical protein  30.61 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4967  hypothetical protein  31.37 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 715 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1650  hypothetical protein  27.85 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443475  normal  0.043655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1982  hypothetical protein  27.85 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00181912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 717 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3164  hypothetical protein  28.92 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147575  normal  0.188251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1404  hypothetical protein  30.12 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>