14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1375 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1375  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  327  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.48826  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0016  hypothetical protein  56.56 
 
 
164 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1035  hypothetical protein  41.3 
 
 
132 aa  82  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0023  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0996823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2828  hypothetical protein  35.64 
 
 
129 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0540  hypothetical protein  41.86 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00507326  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2099  hypothetical protein  32.32 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2332  hypothetical protein  36.45 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00672726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2637  hypothetical protein  36.17 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.813016  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4416  hypothetical protein  34.94 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1398  hypothetical protein  32.5 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3164  hypothetical protein  30.61 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147575  normal  0.188251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1404  hypothetical protein  29.53 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4967  hypothetical protein  27.06 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>