14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0552 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0552  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  939    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.092492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0524  hypothetical protein  30.39 
 
 
463 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.195293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2261  hypothetical protein  25.86 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0068  hypothetical protein  26.29 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000118188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.67 
 
 
966 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  33.33 
 
 
341 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  24.35 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  27.39 
 
 
1202 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  25.78 
 
 
684 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  31.15 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  23.71 
 
 
609 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0149  S-layer-like domain-containing protein  26.97 
 
 
1113 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285183  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  25.12 
 
 
435 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 
760 aa  43.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>