25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0061 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0061  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  769    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1026  hypothetical protein  58.18 
 
 
422 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441563  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0271  hypothetical protein  35.39 
 
 
483 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1253  hypothetical protein  37.85 
 
 
415 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0063  hypothetical protein  37.68 
 
 
380 aa  215  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0492  hypothetical protein  35.84 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.65383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2930  hypothetical protein  33.59 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000188138  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1648  hypothetical protein  36.42 
 
 
455 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.544844  hitchhiker  0.00111677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1820  hypothetical protein  35.94 
 
 
430 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0757  hypothetical protein  32.72 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.503985  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0320  hypothetical protein  33.52 
 
 
459 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.758746  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2039  hypothetical protein  31.63 
 
 
463 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217007  normal  0.109783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  39.88 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0195  hypothetical protein  26.63 
 
 
391 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000146938  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2383  hypothetical protein  27.44 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0522  hypothetical protein  32.26 
 
 
505 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.263879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2198  S-layer-like domain-containing protein  24.05 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1655  S-layer-like domain-containing protein  22.65 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.19387  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0700  hypothetical protein  22.15 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1517  hypothetical protein  28.73 
 
 
498 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1425  S-layer-like domain-containing protein  24.54 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137658  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0586  hypothetical protein  23.64 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000473168  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0891  S-layer protein  29.46 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.987001  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0080  hypothetical protein  24.89 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000412436  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1529  hypothetical protein  28.02 
 
 
866 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.114366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>