22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5014 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  338  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  80.57 
 
 
174 aa  278  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  53.85 
 
 
175 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  51.92 
 
 
177 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  51.92 
 
 
177 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  51.01 
 
 
177 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  39.38 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  41.72 
 
 
166 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  41.36 
 
 
191 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  36.42 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  41.91 
 
 
163 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  37.04 
 
 
176 aa  94  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  37.86 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  35.66 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  32.72 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  84  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  35.33 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  32.12 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  26.62 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  29.41 
 
 
198 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>