More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0890 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  47.9 
 
 
665 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
684 aa  1403    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  47.82 
 
 
664 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  47.44 
 
 
662 aa  620  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  47.29 
 
 
662 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  47.31 
 
 
662 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  47.29 
 
 
662 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  47.44 
 
 
662 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  47.29 
 
 
662 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  47.14 
 
 
662 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  47.14 
 
 
662 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  47.14 
 
 
662 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  47.3 
 
 
662 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  46.23 
 
 
662 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  45.13 
 
 
664 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  45.13 
 
 
664 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  45.78 
 
 
664 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  41.93 
 
 
680 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  41.68 
 
 
680 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  42.32 
 
 
631 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  42.11 
 
 
631 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  38.13 
 
 
743 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  39.56 
 
 
669 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  39.7 
 
 
669 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  36.66 
 
 
713 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  38.79 
 
 
721 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  38.79 
 
 
587 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  38.94 
 
 
587 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  36.34 
 
 
741 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  38.9 
 
 
691 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  36.15 
 
 
747 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  37.98 
 
 
784 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  39.82 
 
 
669 aa  462  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  38.4 
 
 
676 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  36.25 
 
 
738 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  37.34 
 
 
697 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  36.95 
 
 
715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  38.07 
 
 
716 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  39.65 
 
 
676 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  37.45 
 
 
667 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  38.73 
 
 
688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  37.59 
 
 
669 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  38.75 
 
 
665 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  39.08 
 
 
666 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  36.1 
 
 
728 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  36.9 
 
 
704 aa  438  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  38.05 
 
 
668 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  36.95 
 
 
714 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 
753 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  37.22 
 
 
712 aa  433  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  36.16 
 
 
711 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  37.15 
 
 
666 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  35.34 
 
 
741 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  35.53 
 
 
740 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  34.88 
 
 
740 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  36.25 
 
 
712 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 
724 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 
662 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 
848 aa  420  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  39.76 
 
 
649 aa  421  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  38.47 
 
 
646 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  35.01 
 
 
712 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  35.24 
 
 
712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  34.86 
 
 
712 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  34.68 
 
 
708 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  36.67 
 
 
669 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  34.65 
 
 
712 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  34.35 
 
 
844 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  34.95 
 
 
665 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  35.36 
 
 
766 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 
717 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  35.57 
 
 
628 aa  398  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  34.12 
 
 
829 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  32.93 
 
 
725 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  35.06 
 
 
713 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  34.87 
 
 
749 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  38.69 
 
 
676 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  35.22 
 
 
766 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  39.14 
 
 
786 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  36.88 
 
 
776 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  34.55 
 
 
785 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 
725 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  35.46 
 
 
772 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  35.32 
 
 
772 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0894  ferrous iron transport protein B  32.77 
 
 
741 aa  385  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.828262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  35.32 
 
 
772 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  35.46 
 
 
772 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  35.32 
 
 
772 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  33.02 
 
 
732 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  34.7 
 
 
717 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  35.6 
 
 
771 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  34.99 
 
 
773 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>