More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0118 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
381 aa  780    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  51.21 
 
 
381 aa  354  1e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 
361 aa  293  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
384 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  40.94 
 
 
385 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  42.3 
 
 
385 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  42.3 
 
 
385 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  40.12 
 
 
385 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  40.12 
 
 
385 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  42.3 
 
 
385 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  40.12 
 
 
385 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  42.3 
 
 
385 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  41.97 
 
 
385 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  39.81 
 
 
385 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  35.67 
 
 
502 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  35.35 
 
 
481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  38.74 
 
 
362 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  34.63 
 
 
501 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  34.33 
 
 
502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
459 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
468 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  36.45 
 
 
469 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  36.13 
 
 
501 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  37 
 
 
480 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  36.13 
 
 
501 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  37 
 
 
501 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  36.13 
 
 
501 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
407 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  37 
 
 
501 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
501 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
501 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  35.39 
 
 
358 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  32.14 
 
 
375 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  32.48 
 
 
337 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  37.69 
 
 
360 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  36.25 
 
 
484 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  36.25 
 
 
484 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  37.05 
 
 
484 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  36.25 
 
 
484 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  31.79 
 
 
368 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  31.79 
 
 
368 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  31.79 
 
 
368 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  36.25 
 
 
484 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  36.25 
 
 
484 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  31.91 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  36.65 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  36.33 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  31.35 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  34.09 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  31.17 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  29.43 
 
 
377 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  33.12 
 
 
368 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  33.44 
 
 
368 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  35.14 
 
 
291 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  38.26 
 
 
386 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  32.53 
 
 
291 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  34.43 
 
 
288 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  29.66 
 
 
368 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  30.75 
 
 
365 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
458 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  32.76 
 
 
352 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  32.85 
 
 
310 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  35.96 
 
 
226 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
462 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
585 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
463 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  32.05 
 
 
608 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
608 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  32.78 
 
 
455 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
513 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  32.78 
 
 
455 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
461 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  34.44 
 
 
603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  32.77 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  28.95 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
603 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.55 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
463 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
423 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
425 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  32.03 
 
 
456 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
457 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
603 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
603 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.97 
 
 
463 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
603 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
603 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
603 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  31.2 
 
 
610 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
463 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>