17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0066 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0066  membrane protein-like protein  100 
 
 
165 aa  328  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0126213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2095  hypothetical protein  30.49 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000837407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0493  hypothetical protein  31.85 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0916  hypothetical protein  35.8 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0102  hypothetical protein  30.41 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1668  hypothetical protein  35.17 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1453  protein of unknown function DUF1393  29.17 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0723727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1767  protein of unknown function DUF1393  26.7 
 
 
183 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0314  membrane protein-like protein  32.67 
 
 
260 aa  59.7  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000003744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0064  hypothetical protein  30.07 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3154  hypothetical protein  25.44 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000133194  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1255  protein of unknown function DUF1393  30.57 
 
 
163 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000641717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1191  hypothetical protein  27.61 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00904414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1376  hypothetical protein  27.61 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00410827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21280  predicted membrane protein  29.33 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000114527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1395  protein of unknown function DUF1393  29.45 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  31.86 
 
 
168 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>