More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1492 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
277 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  69.09 
 
 
264 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.04 
 
 
271 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2087  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.42 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228254  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2874  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.04 
 
 
271 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.18 
 
 
275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3224  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.22 
 
 
277 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.87 
 
 
276 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.45 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.13 
 
 
270 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.81 
 
 
300 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2763  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.77 
 
 
287 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.323857  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.15 
 
 
300 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.82 
 
 
303 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0991  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.32 
 
 
277 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1075  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.32 
 
 
277 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.786743  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.71 
 
 
263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.64 
 
 
283 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.5 
 
 
296 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.16 
 
 
301 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.27 
 
 
261 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.16 
 
 
296 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.16 
 
 
296 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.83 
 
 
301 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.65 
 
 
261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.65 
 
 
262 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.9 
 
 
289 aa  267  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.66 
 
 
296 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.99 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.32 
 
 
296 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.32 
 
 
296 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.34 
 
 
301 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.56 
 
 
265 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.26 
 
 
266 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.26 
 
 
266 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.51 
 
 
265 aa  261  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0834  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.01 
 
 
297 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.08 
 
 
271 aa  258  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.25 
 
 
269 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.54 
 
 
268 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.54 
 
 
268 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.13 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
268 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
270 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.1 
 
 
273 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.28 
 
 
270 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.35 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.27 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
262 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.56 
 
 
262 aa  241  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.97 
 
 
289 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.99 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.31 
 
 
287 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.18 
 
 
283 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
273 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.24 
 
 
267 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.91 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.74 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.64 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.31 
 
 
287 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.74 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
263 aa  238  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.33 
 
 
290 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.72 
 
 
270 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.36 
 
 
272 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.46 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.76 
 
 
290 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.41 
 
 
276 aa  232  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
291 aa  231  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.07 
 
 
269 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.18 
 
 
268 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.72 
 
 
269 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
268 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
268 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.69 
 
 
269 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
268 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
290 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
290 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.72 
 
 
269 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
290 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.08 
 
 
268 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.91 
 
 
266 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.08 
 
 
291 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
268 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>