13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0046 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0044  adhesion exoprotein  46.72 
 
 		 873 aa  781    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0046  adhesion exoprotein  100 
 
 		 985 aa  1998    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0944  adhesion exoprotein  33.42 
 
 		 524 aa  234  6e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00559736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0939  adhesion exoprotein  31.52 
 
 		 615 aa  229  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000746139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  31.4 
 
 		 3692 aa  201  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1725  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1993 aa  131  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  23.92 
 
 		 2449 aa  103  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10770  MucBP-like protein  41.67 
 
 		 721 aa  73.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.712017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  23.44 
 
 		 2833 aa  72.4  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0410  adhesion exoprotein  24.16 
 
 		 2457 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1655  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1425 aa  70.1  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0143  adhesion exoprotein  23.77 
 
 		 2823 aa  62.4  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  25.85 
 
 		 996 aa  51.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>