More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1256 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1256  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  100 
 
 
329 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.244091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1087  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  77.81 
 
 
327 aa  534  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3971  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  75.77 
 
 
327 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5640  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.85 
 
 
328 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000662173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5594  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.85 
 
 
327 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5369  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.85 
 
 
328 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  hitchhiker  0.00000803843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5249  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  75.15 
 
 
327 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5578  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  75.15 
 
 
328 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5137  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.54 
 
 
327 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.355438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5550  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.54 
 
 
328 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000607148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5309  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.23 
 
 
327 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.631768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5151  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.23 
 
 
327 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000104807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5705  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.23 
 
 
327 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0906  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  74.14 
 
 
325 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1398  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.9 
 
 
325 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000185799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1425  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.9 
 
 
325 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0068  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  68.12 
 
 
324 aa  481  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000829344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0389  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  67.17 
 
 
330 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000244366  hitchhiker  0.0000000000000331552 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0535  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  64.49 
 
 
323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000822537  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl170  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  67.41 
 
 
320 aa  444  1e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1534  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  65.81 
 
 
325 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3326  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  66.13 
 
 
325 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2679  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  66.13 
 
 
325 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1911  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  64.86 
 
 
325 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120431  hitchhiker  0.00269359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5332  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  64.22 
 
 
325 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1718  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  64.22 
 
 
325 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.794876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1472  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  63.84 
 
 
325 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601971  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1695  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  62.3 
 
 
322 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2764  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  63.9 
 
 
325 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.238599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3037  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  63.26 
 
 
325 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  37.87 
 
 
368 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  36.28 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  35.96 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4233  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.85 
 
 
347 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439101  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1080  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  34.46 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.64 
 
 
347 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0639635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3373  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  34.26 
 
 
347 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  34.26 
 
 
347 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0580253  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1044  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  34.26 
 
 
347 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0547285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06224  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.85 
 
 
347 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000471  GMP reductase  33.54 
 
 
347 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0663  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.92 
 
 
346 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0775  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.85 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3408  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.64 
 
 
346 aa  172  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.28 
 
 
508 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0161  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000034815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.5 
 
 
482 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0155  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00144171  normal  0.0933514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0154  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000490332  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0158  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0153  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  45.5 
 
 
482 aa  168  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2687  Malate dehydrogenase  35.11 
 
 
354 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3765  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.04 
 
 
346 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3578  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.45 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0097  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000247841  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2902  hypothetical protein  33.13 
 
 
337 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2755  hypothetical protein  33.13 
 
 
337 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3497  guanosine monophosphate reductase  32.84 
 
 
347 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0111  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.14 
 
 
347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000028675  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00104  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.84 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00103  hypothetical protein  32.84 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0109  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.84 
 
 
347 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000081181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0108  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.84 
 
 
347 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3554  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.84 
 
 
347 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0649  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.24 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.453768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0106  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.55 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0096  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.92 
 
 
345 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.31 
 
 
485 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0078  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.92 
 
 
345 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.76224e-28 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.37 
 
 
497 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.3 
 
 
496 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.78 
 
 
483 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.16 
 
 
484 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
486 aa  157  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.73 
 
 
496 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40 
 
 
483 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.84 
 
 
488 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.79 
 
 
380 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  43.41 
 
 
497 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.38 
 
 
504 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.42 
 
 
488 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.76 
 
 
487 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.76 
 
 
487 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  41.49 
 
 
487 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.76 
 
 
487 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0224  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.27 
 
 
485 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.218435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  40.81 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.09 
 
 
485 aa  153  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  39.83 
 
 
488 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.65 
 
 
485 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.32 
 
 
485 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1106  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.08 
 
 
483 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0217  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  30.35 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.34 
 
 
487 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  35.31 
 
 
497 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.34 
 
 
487 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.2 
 
 
476 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.34 
 
 
487 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.6 
 
 
485 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>