More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0108 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00104  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  99.42 
 
 
347 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3497  guanosine monophosphate reductase  99.42 
 
 
347 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0097  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  99.14 
 
 
347 aa  708    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000247841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0158  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  94.52 
 
 
347 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0161  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  94.81 
 
 
347 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000034815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0108  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3554  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  99.71 
 
 
347 aa  714    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0109  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  99.71 
 
 
347 aa  714    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000081181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0155  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  94.81 
 
 
347 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00144171  normal  0.0933514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0153  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  94.81 
 
 
347 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.774508  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0111  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  99.42 
 
 
347 aa  713    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000028675  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0649  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  92.22 
 
 
347 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.453768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0154  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  94.81 
 
 
347 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000490332  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0106  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  99.42 
 
 
347 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00103  hypothetical protein  99.42 
 
 
347 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3578  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  86.38 
 
 
346 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0775  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  85.26 
 
 
347 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3765  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  85.8 
 
 
346 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1044  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  84.88 
 
 
347 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0547285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  84.88 
 
 
347 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0580253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3373  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  84.88 
 
 
347 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0663  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  80 
 
 
346 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0624  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  82.03 
 
 
346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0602959  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06224  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.26 
 
 
347 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4233  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.97 
 
 
347 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000471  GMP reductase  73.55 
 
 
347 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0501  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.38 
 
 
347 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0639635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0078  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  73.84 
 
 
345 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.76224e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0096  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.67 
 
 
345 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600015  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1080  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  72.38 
 
 
347 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3408  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  71.39 
 
 
346 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.163822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0217  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.67 
 
 
347 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5041  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  56.82 
 
 
347 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0604  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  57.1 
 
 
347 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1029  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  50.68 
 
 
367 aa  373  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2902  hypothetical protein  35 
 
 
337 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2755  hypothetical protein  35 
 
 
337 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  36.83 
 
 
374 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.27 
 
 
380 aa  189  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3266  GMP reductase  35.98 
 
 
368 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.43 
 
 
508 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0041  IMP dehydrogenase/GMP reductase  33.8 
 
 
384 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1064  GMP reductase  36.72 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.361476  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  36.64 
 
 
369 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.27 
 
 
482 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.98 
 
 
482 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  33.24 
 
 
484 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.58 
 
 
488 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.46 
 
 
483 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.01 
 
 
485 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
497 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.09 
 
 
491 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1127  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.43 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000270815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.36 
 
 
496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.91 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.36 
 
 
496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.02 
 
 
484 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_002620  TC0443  inosine-5`-monophosphate dehydrogenase, putative  33.43 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.6 
 
 
490 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.19 
 
 
488 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.18 
 
 
485 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1087  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.24 
 
 
327 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.1 
 
 
498 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3037  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  35.08 
 
 
325 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.74 
 
 
489 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0068  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  33.23 
 
 
324 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000829344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.91 
 
 
486 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  32.75 
 
 
380 aa  169  7e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.75 
 
 
496 aa  169  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.28 
 
 
492 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  30.85 
 
 
373 aa  169  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.3 
 
 
486 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.1 
 
 
498 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.83 
 
 
493 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.75 
 
 
483 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
499 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.01 
 
 
486 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  40.37 
 
 
484 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.68 
 
 
488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2687  Malate dehydrogenase  33.24 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.61 
 
 
496 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.9 
 
 
496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1790  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  40.74 
 
 
499 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.1 
 
 
485 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1256  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  32.84 
 
 
329 aa  165  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.244091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.28 
 
 
496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1027  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.35 
 
 
485 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.39 
 
 
476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.54 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.09 
 
 
485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.4 
 
 
491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.54 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  41.18 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.73 
 
 
489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.54 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.48 
 
 
486 aa  164  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  39.35 
 
 
497 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  40.54 
 
 
487 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.12 
 
 
483 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>