33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0867 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  480  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  53.12 
 
 
258 aa  254  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  43.02 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  32.49 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  32.91 
 
 
257 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  28.06 
 
 
261 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.36 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.36 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  29.44 
 
 
385 aa  79  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  25.94 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  22.27 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  23.62 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  23.18 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  26.05 
 
 
416 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  25.32 
 
 
393 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  25.22 
 
 
434 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25 
 
 
382 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1824  multitransmembrane protein  24.78 
 
 
258 aa  58.5  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  26.25 
 
 
451 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  25.1 
 
 
345 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  23.12 
 
 
392 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  26.97 
 
 
386 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  23.81 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  23.43 
 
 
436 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  25.81 
 
 
446 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  20.69 
 
 
381 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  25.1 
 
 
370 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  25.1 
 
 
370 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  24.46 
 
 
370 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  33.33 
 
 
395 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  25.94 
 
 
499 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  26.2 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  26.47 
 
 
484 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>