18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00540  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  209  8e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.31 
 
 
294 aa  64.3  5e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.24 
 
 
303 aa  60.8  6e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.8 
 
 
296 aa  57.4  7e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  45.45 
 
 
221 aa  56.2  2e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45.88 
 
 
293 aa  52.4  2e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
289 aa  52.4  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  36.63 
 
 
189 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  35.24 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  35.24 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1038  hypothetical protein  41.03 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  37.21 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  38.82 
 
 
315 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.44 
 
 
304 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  34.12 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
277 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  40.79 
 
 
298 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.06 
 
 
322 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>