114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2349 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  100 
 
 
220 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  39.24 
 
 
173 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  36.54 
 
 
158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  34.15 
 
 
175 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  39.74 
 
 
176 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  40.88 
 
 
178 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  33.73 
 
 
178 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  37.5 
 
 
170 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  32.47 
 
 
176 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  31.74 
 
 
175 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  31.74 
 
 
175 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  34.19 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  34.38 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  34.19 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  38.69 
 
 
375 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  36.57 
 
 
176 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  32.08 
 
 
185 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  26.45 
 
 
176 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  35.26 
 
 
170 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  37.58 
 
 
178 aa  88.6  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  33.55 
 
 
319 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  32.43 
 
 
171 aa  88.2  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  33.15 
 
 
192 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  25.16 
 
 
176 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  34.88 
 
 
406 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  33.77 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  28.32 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  29.24 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3527  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00787639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  29.01 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  33.55 
 
 
166 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  32.48 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  26.22 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  28.05 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  30.92 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  31.36 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  31.85 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  30.92 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  40.46 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  33.53 
 
 
347 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  29.94 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  31.85 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  31.85 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  31.85 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  31.85 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  29.94 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  30.06 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  31.37 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  31.21 
 
 
174 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  31.21 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  36.21 
 
 
175 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  29.81 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  33.52 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  29.94 
 
 
174 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  30.15 
 
 
157 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  28.92 
 
 
601 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  32.45 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1356  protein of unknown function UPF0157  30 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  35.29 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  33.74 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  31.21 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02587  hypothetical protein  32.09 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  31.69 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3227  hypothetical protein  34.88 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  35.03 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  41.51 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  25.15 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  31.55 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  33.88 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  25.42 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1247  protein of unknown function UPF0157  53.52 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  30.67 
 
 
365 aa  62  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  30.07 
 
 
171 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  23.84 
 
 
169 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  24 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06714  hypothetical protein  30.49 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  23.46 
 
 
169 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  46.75 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  22.64 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  22.5 
 
 
169 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  22.5 
 
 
169 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.16 
 
 
402 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  22.01 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  35.23 
 
 
395 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  21.47 
 
 
169 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  22.01 
 
 
172 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  24.43 
 
 
150 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  32.09 
 
 
169 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  28.31 
 
 
410 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.05 
 
 
430 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  27.16 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>