40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1507 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  75 
 
 
202 aa  305  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  59.07 
 
 
193 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  53.68 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  54.26 
 
 
197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  37.5 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  36.56 
 
 
194 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  32.97 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  34.29 
 
 
195 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  32.78 
 
 
191 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  32.47 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  29.41 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  25.95 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  30.72 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  30.64 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  27.43 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  28.98 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  30.41 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  29.55 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  28.98 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  28.98 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  26.97 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  27 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  28.66 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  27 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  28.98 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  28.98 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  24.63 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  27.16 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  27.56 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  30.56 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  27.5 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  26.32 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  22.28 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  20.9 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  24 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  23.76 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07484  Uncharacterized protein AN7484 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW46]  34.38 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  29.66 
 
 
207 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>