12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0466 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  100 
 
 
440 aa  888    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  75 
 
 
424 aa  614  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  68.17 
 
 
431 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  42.64 
 
 
425 aa  272  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  42.22 
 
 
425 aa  271  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  34.65 
 
 
406 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  36.03 
 
 
406 aa  179  7e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  34.66 
 
 
414 aa  173  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  32.44 
 
 
402 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  30.26 
 
 
420 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  28.57 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  29.17 
 
 
405 aa  123  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>