17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0090 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  100 
 
 
82 aa  164  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  69.44 
 
 
82 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  60 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1043  protein of unknown function UPF0044  68.06 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  52.44 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  40.28 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1520  hypothetical protein  31.94 
 
 
127 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1155  hypothetical protein  30.56 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  34.67 
 
 
82 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  38.36 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  30.56 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0996  hypothetical protein  34.29 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  43.28 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1888  hypothetical protein  38.89 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0925  hypothetical protein  36.23 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0729  hypothetical protein  39.44 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.951229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>