229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0065 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  96.61 
 
 
77 bp  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.37653e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  94.2 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  91.55 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  9.2316e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  1.67821e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  3.76557e-08  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  92.75 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  92.75 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  93.44 
 
 
74 bp  89.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0007  tRNA-Arg  95.08 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.818817  hitchhiker  1.44488e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0061  tRNA-Arg  93.65 
 
 
73 bp  85.7  1e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0059  tRNA-Arg  94.92 
 
 
76 bp  85.7  1e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  97.78 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  91.3 
 
 
73 bp  81.8  2e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  89.86 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  93.33 
 
 
73 bp  79.8  8e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.7529e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  90.28 
 
 
76 bp  79.8  8e-14  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  91.53 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0011  tRNA-Arg  92.06 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  92.06 
 
 
73 bp  77.8  3e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  91.53 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  91.53 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  92.06 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  91.53 
 
 
74 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  8.84624e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  89.33 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  92.06 
 
 
76 bp  77.8  3e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.32 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0063  tRNA-Arg  94.44 
 
 
76 bp  75.8  1e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14043  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0938748  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  88.41 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  97.56 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  87.01 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0006  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0006  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01900  tRNA-Arg  92.98 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  92.98 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  89.86 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26100  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0006  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.53452e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  92.98 
 
 
73 bp  73.8  5e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  92.98 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  92.86 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0072  tRNA-Arg  95.45 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0596228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0075  tRNA-Arg  95.45 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336588  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0073  tRNA-Arg  95.45 
 
 
74 bp  71.9  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334758  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0074  tRNA-Arg  95.45 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.214945  normal  0.0186415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  91.67 
 
 
73 bp  71.9  2e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.81617e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.77575e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.88984e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.12746e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0032  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.67893e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.84073e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.67 
 
 
80 bp  69.9  8e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.23953e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0084  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.44766e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.2092e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0005  tRNA-Arg  90.48 
 
 
73 bp  69.9  8e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.9458e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  92.16 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  1.93558e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.78577e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.67 
 
 
80 bp  69.9  8e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.2583e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  86.67 
 
 
80 bp  69.9  8e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.43078e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1576  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1611  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.19464e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  88.71 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  88.71 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.27432e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  88.71 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.01078e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>