More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4001 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  100 
 
 
89 aa  183  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  80.68 
 
 
93 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  76.4 
 
 
90 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  77.27 
 
 
94 aa  149  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  81.93 
 
 
93 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  75 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  80.72 
 
 
93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  75.28 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  76.74 
 
 
93 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
92 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
93 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
98 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
98 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
98 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  72.09 
 
 
95 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  71.59 
 
 
91 aa  135  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  76.19 
 
 
96 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  71.59 
 
 
91 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 
93 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 
93 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  74.42 
 
 
93 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  70.93 
 
 
93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  69.66 
 
 
93 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  69.32 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  69.32 
 
 
90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  68.6 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  67.42 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  70.45 
 
 
91 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
95 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
95 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
95 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
93 aa  131  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  70.45 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  64.77 
 
 
90 aa  130  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
92 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0331  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.782912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0501  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.245723  hitchhiker  0.000000000273947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  68.18 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  65.91 
 
 
90 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  69.32 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  129  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0841  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08890  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000166272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  67.05 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4544  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  64.04 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  64.04 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  68.18 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5075  30S ribosomal protein S19  65.91 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.273051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  68.18 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  64.77 
 
 
91 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  64.77 
 
 
92 aa  127  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
92 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  65.17 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  65.91 
 
 
90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  67.05 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>