17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3358 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3359  hypothetical protein  64.94 
 
 
585 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0360212  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3358  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1194    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0055195  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3357  hypothetical protein  60.99 
 
 
585 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.205897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3356  hypothetical protein  55.26 
 
 
603 aa  605  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0856  hypothetical protein  29.63 
 
 
404 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0816  hypothetical protein  29.13 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844622  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1991  hypothetical protein  23.68 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  0.0451429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7862  hypothetical protein  26.09 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1964  hypothetical protein  23.68 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6646  Protein of unknown function DUF2330  25.28 
 
 
549 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1983  hypothetical protein  25.38 
 
 
450 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.523491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1584  hypothetical protein  30.51 
 
 
363 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13764  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.815237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4968  hypothetical protein  24.24 
 
 
455 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4008  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  57.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4059  hypothetical protein  24.51 
 
 
464 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4567  hypothetical protein  31 
 
 
448 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>