41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3265 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3265  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  281  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.460792  decreased coverage  0.00938661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1752  hypothetical protein  52.63 
 
 
120 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1444  hypothetical protein  41.23 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.273597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  80.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2150  hypothetical protein  42.72 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3916  hypothetical protein  48.75 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80625 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5229  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183804  normal  0.664868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4148  hypothetical protein  46.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5497  hypothetical protein  48.72 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2214  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1935  hypothetical protein  40.66 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.0079788  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1703  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2932  hypothetical protein  38.74 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0338  hypothetical protein  38.89 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000351348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3831  hypothetical protein  47.62 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0114  hypothetical protein  37.61 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1750  hypothetical protein  37.61 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377794  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2206  transmembrane prediction  45.24 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270827  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3114  hypothetical protein  37.04 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749188  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2962  hypothetical protein  46.43 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0939229  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4322  hypothetical protein  53.73 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0257021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0412  hypothetical protein  40.57 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1823  hypothetical protein  37.25 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2950  hypothetical protein  43.9 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.120168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1126  hypothetical protein  46.43 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3098  hypothetical protein  41.38 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1501  hypothetical protein  40.74 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522888  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1853  hypothetical protein  45.35 
 
 
183 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2516  hypothetical protein  43.82 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0776456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2444  hypothetical protein  42.7 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2739  hypothetical protein  43.82 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729957  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3986  hypothetical protein  38.67 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4412  hypothetical protein  45.45 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91553  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1466  hypothetical protein  40.28 
 
 
133 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.967848 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32818  predicted protein  32.67 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179933  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00655  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03090  expressed protein  37.68 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379491  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01610  conserved hypothetical protein  35.92 
 
 
245 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3851  hypothetical protein  35.8 
 
 
147 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0983307  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26814  predicted protein  36.96 
 
 
252 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00061  conserved hypothetical protein  43.48 
 
 
237 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0240751  normal  0.829799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>