30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1904 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1904  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  247  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000231633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  28.8 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  39.44 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  40.68 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  35.06 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  33.77 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  38.98 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  38.98 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.21 
 
 
817 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  35.21 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  40.68 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  24.83 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  37.29 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.77 
 
 
864 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 
817 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  23.72 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
834 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  41.18 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 
831 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  39.22 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  22.12 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  30.51 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  43.48 
 
 
138 aa  40  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>