16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3317 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  741    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  46.09 
 
 
379 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  37.59 
 
 
407 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  36.65 
 
 
416 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  37.34 
 
 
373 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  33.51 
 
 
380 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  37.46 
 
 
403 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  36.39 
 
 
309 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  31.65 
 
 
380 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  32.31 
 
 
380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  35.09 
 
 
394 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  33.63 
 
 
369 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.05 
 
 
293 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  22.09 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  22.33 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>