40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1279 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  38.68 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  38.1 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  41.58 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  41.58 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  41.09 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  38.2 
 
 		 172 aa  115  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  38.79 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  36.6 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  38.92 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  39.52 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  40.35 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  35.91 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  37.08 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  34.15 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  38.12 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  41.9 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  33.89 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  37.3 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  40.8 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  38.73 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  33.51 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  34.18 
 
 		 197 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  35.12 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  33.68 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  30.54 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  31.55 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  33.73 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  38.1 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  34.44 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  28.57 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  27.94 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  30.65 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  29.41 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  28.81 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  33.11 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  28.65 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  38 
 
 		 115 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  25.27 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.413386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>