46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0404 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  44.74 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  40 
 
 
204 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  40.31 
 
 
200 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  38.25 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  36.96 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  40.32 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  40.22 
 
 
206 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  36.82 
 
 
213 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  37.17 
 
 
220 aa  121  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  41.07 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  40.61 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  39.39 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  35.33 
 
 
206 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  36.04 
 
 
198 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  31.28 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  36.18 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  32.55 
 
 
211 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  39.35 
 
 
199 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  39.66 
 
 
201 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  32.32 
 
 
222 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  37.57 
 
 
196 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  32.32 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  32.32 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  31.75 
 
 
201 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  33.33 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  34.25 
 
 
363 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  32.35 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  34.91 
 
 
172 aa  91.7  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  37.5 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  34.09 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  34.95 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  33.33 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  38.05 
 
 
115 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  28.57 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  31.19 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  30.53 
 
 
412 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0123  hypothetical protein  27.71 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.142779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  30.89 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  28.34 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  37.63 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3308  hypothetical protein  24.04 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2809  hypothetical protein  24.04 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  30.33 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  30.33 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4459  hypothetical protein  26.88 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>