42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2524 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  97.77 
 
 
197 aa  357  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  75.42 
 
 
179 aa  278  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  45.4 
 
 
200 aa  148  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  42.29 
 
 
199 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  41.07 
 
 
204 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  38.07 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  36.41 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  36.41 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  36.41 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  37.63 
 
 
196 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  36.46 
 
 
218 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  30.43 
 
 
187 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  32.98 
 
 
220 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  40.23 
 
 
201 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  33.33 
 
 
205 aa  97.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  36.96 
 
 
214 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  35.14 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  30.43 
 
 
211 aa  91.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  36.6 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  30.73 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  33.52 
 
 
189 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  35.57 
 
 
208 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  35.23 
 
 
208 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  31.07 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  29.61 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  29.67 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  32.8 
 
 
213 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  32.78 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  33.12 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  32.09 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  29.7 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  35.88 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  30.1 
 
 
231 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  30.1 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  30.49 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  33.12 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  29.41 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  37.29 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  32.14 
 
 
115 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  25.53 
 
 
412 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  28.65 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>