20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2350 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  28.96 
 
 
346 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  28.72 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  26.25 
 
 
353 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  21.9 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  21.45 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  21.28 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  23.11 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  23.77 
 
 
355 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  20.65 
 
 
343 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  23.64 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  25.7 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  25.65 
 
 
361 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  20.72 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  23.1 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  21.27 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  22.91 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  21.65 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  20.9 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  21.15 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>