22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2533 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2533  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1444  protein of unknown function DUF169  43.68 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2166  protein of unknown function DUF169  43.8 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2491  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0320  protein of unknown function DUF169  41.18 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.129666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0915  hypothetical protein  35.05 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.155446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1527  hypothetical protein  26.79 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2252  protein of unknown function DUF169  25.39 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0039  hypothetical protein  30.68 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0116  protein of unknown function DUF169  23.7 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011799  hitchhiker  0.00705283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1376  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2259  hypothetical protein  24.18 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1649  hypothetical protein  28.08 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0406  hypothetical protein  24.81 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2893  hypothetical protein  29.87 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2260  hypothetical protein  22.42 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.087732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0332  hypothetical protein  22.92 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0407  hypothetical protein  23.34 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3015  hypothetical protein  24.51 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.667221  normal  0.0266748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2481  hypothetical protein  26.03 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1049  hypothetical protein  27.03 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.931099  normal  0.654081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>